合伙企業(yè)中的自然人合伙人按照經(jīng)營所得來繳納個人所得稅，稅率是5%——35%。合伙企業(yè)經(jīng)營所得和其他所得采取“先分后稅”原則，合伙企業(yè)將全部的生產(chǎn)經(jīng)營所得按照合伙協(xié)議約定的分配比例（合伙協(xié)議沒有約定分配比例的，以全部生產(chǎn)經(jīng)營所得和合伙人數(shù)量平均計算每個合伙人的應(yīng)納稅所得額），分配到每個合伙人頭上，確定每個合伙人應(yīng)納稅所得額，計算繳納所得稅。

合伙企業(yè)經(jīng)營所得就等于合伙企業(yè)收入減去成本費用稅金以及彌補以前年度虧損后的余額，將這個余額根據(jù)合伙協(xié)議約定的分配比例（合伙人協(xié)商確定的比例或平均分配的比例）分?jǐn)偟矫總€合伙人頭上，如果合伙人是法人企業(yè)的，并入其企業(yè)所得稅應(yīng)納稅所得額，繳納企業(yè)所得稅；如果合伙人是個人的，確定經(jīng)營所得應(yīng)納稅所得額，計算繳納個人所得稅。

應(yīng)納個稅=應(yīng)納稅所得額×適用稅率-速算扣除數(shù)

合伙企業(yè)個人合伙人按月或季度預(yù)繳經(jīng)營所得個稅，填列個人所得稅經(jīng)營所得申報表（A表），預(yù)繳個稅時，應(yīng)納稅所得額就等于合伙企業(yè)收入減去成本費用稅金減去彌補以前年度的虧損后的余額，乘以該合伙人分配比例，再扣除該合伙人允許扣除的個人費用及其他扣除。允許扣除的個人費用及其他扣除包括每月5000元的基本費用扣除（一年扣除6萬），納稅人承擔(dān)的三險一金專項扣除，以及依法確定的其他扣除可以稅前扣除。

即應(yīng)納稅所得額=（收入-成本-費用-稅金-彌補以前年度虧損）×分配比例-允許扣除的個人費用及其他扣除

得出的應(yīng)納稅所得額適用《經(jīng)營所得稅率表》確認(rèn)適用稅率和速算扣除數(shù)，本季度需要預(yù)繳稅款=應(yīng)納稅所得額×適用稅率-速算扣除數(shù)-減免稅額-本年度已繳稅額

次年3月31日之前，需要辦理經(jīng)營所得匯算清繳，填列《個人所得稅經(jīng)營所得納稅申報表（B表）》，注意，如果合伙人沒有工資薪金等綜合所得，符合條件可以享受的子女教育、贍養(yǎng)老人等專項附加扣除，在匯算清繳時可以填列相關(guān)信息稅前扣除。

如果納稅人在境內(nèi)有兩處或兩處以上經(jīng)營所得的，需要進行年度匯總納稅申報，將從各處取得的經(jīng)營所得年度應(yīng)納稅所得額進行合并，如果出現(xiàn)減除費用等重復(fù)扣除的，需要納稅調(diào)增，合并各處應(yīng)納稅所得額后，確認(rèn)適用稅率和速算扣除數(shù)，如果預(yù)繳稅款低于實際應(yīng)繳納的稅款的，需要補稅。