大眾桑塔納天窗漏水通常是這圈密封膠條老化，或是天窗邊緣出現形變，都會導致天窗密封不嚴，進入天窗內的水量便會明顯增加，也加大了水流進車內的概率。更換新的密封條即可。雖然天窗也是車窗的一部分，但其機械結構與車門窗并不一樣，而且也嬌氣多了，因此其使用頻率不能太高。車輛行駛在顛簸路段時，最好也不要打開天窗。車在不平整的路面上行駛，不僅車內的人受不了，而且天窗也容易被顛出問題。