1、1984年，鐘南山被授予中國首批國家級有突出貢獻專家稱號。2、1992年，鐘南山獲中國全國衛生系統模范工作者稱號。3、1997年1月15日，鐘南山被中共廣州市委授予模范共產黨員的稱號。4、2003年，鐘南山被廣州市授予抗非英雄榮譽稱號。5、2004年4月8日，鐘南山被授予中國國內衛生系統的最高榮譽稱號——白求恩獎章。6、2018年12月18日，黨中央、國務院授予鐘南山同志改革先鋒稱號，頒授改革先鋒獎章，并獲評公共衛生事件應急體系建設的重要推動者。7、2020年8月11日，習近平簽署主席令，授予鐘南山共和國勛章。