新鮮猴頭菇和干猴頭菇都不能放入冰箱冷凍保存，新鮮猴頭菇的適宜保存溫度為2~4攝氏度，而冷凍層的溫度過低，會破壞其中的組織細胞，導致猴頭菇的營養流失，使其口感和營養變差；而對于干猴頭菇，冷凍層的水汽較多，如果沒有包裹好，很容易使水汽滲入而變得潮濕，反而會加速其變質。