咸鴨蛋變臭是因為存放過久，或有裂縫，隨著蛋清中的殺菌素逐漸減少，通過蛋殼氣孔或裂縫侵入的細菌大量繁殖，產生甲烷、氮、氨、二氧化碳等物質，發出惡臭。臭蛋經烹調后，其中的胺類、亞硝酸鹽、細菌毒素等依然存在，食后會引起惡心、嘔吐等中毒癥狀。