自來水中不會有食腦蟲。食腦蟲一般都會在一些湖泊、溫泉或者比較臟的游泳池中出現。自來水都是經過層層殺毒處理，這類水之中不容易帶有食腦蟲這類病毒。但不要直接飲用自來水，最好燒開飲用。如果自來水出現渾濁，有異常顏色或是有刺激性氣味，不建議飲用。如果是一夜沒用的水管，應打開水龍頭讓水流一會兒，這一部分水可以做清潔用，不要飲用。之后接的水燒開，沸騰后揭開蓋子讓其再沸騰３分鐘，減少一些有害物質。