耗氧，降低水中溶解氧含量；產生過多亞硝酸和硝酸，促使水質酸化；硝氮（硝酸根）產生過多，容易使魚缸爆藻；硝酸根濃度過大，使魚產生鹽分毒害等幾個方面。硝化細菌是好氧菌，無論是亞硝化反應，還是硝化反應，都需要氧氣參與。因此，硝化細菌加多了，自然會大量消耗水中的氧氣。魚也是需要氧氣的，特別是高氧魚，對氧氣的需求更大。而一定溫度下，水中溶解的氧氣總量是有限度的，由此形成硝化細菌和魚對氧氣的競爭關系。