硝化細菌不僅在開缸的時候需要添加，在日常的水質維護中，也應定期添加硝化細菌。每1－2周添加一次即可。由于添加硝化細菌要完全穩定要３－５天，因此不能等水質惡化時才加，建議定期添加。加入硝化細菌會加快水質中硝化系統的培養。如果水質正常，多添加的硝化菌也不會造成任何問題。此外，在缸內使用殺菌類藥物也會造成硝化細菌的損失，因此施藥后治療完成，在一定時間后，也需要及時補充硝化細菌。因此才會建議日常應定期添加硝化細菌。