1、地窖貯藏：冬瓜地窖貯藏應選擇果皮厚、果肉厚、質地致密、表皮鮮綠色、蠟質、大小均勻、無損傷的晚熟大品種。地窖的大小由儲存的數量決定。通常在30平方米左右，儲存5000公斤冬瓜。地窖大多為半地下式，高3.6米，地上、地下各1.8米。在周圍設置庫窗并打開，便于通風換氣。2、熏蒸儲藏：冬瓜在儲藏前兩到三天，用高錳酸鉀密封熏蒸。在地上鋪干草或草簾，冬瓜堆放不超過三層，以免壓壞。擺瓜的方向要和田間生長時的狀態一致，以保持冬瓜原有的重力方向，如此果肉不易開裂，便可儲藏過冬。貯藏期間，不要隨意翻動，發現有病的瓜立即挑出。注意加強通風，散熱降溫同時也排除潮氣，保持環境干燥。3、冷庫貯藏：冬瓜可利用冷庫進行保鮮，冷藏溫度在10~15℃，相對濕度為70%~85%，可存貯4~6個月。