在第三新東京市的地下發(fā)現(xiàn)了巨大的空洞空間，空洞底下是后來(lái)nerv的最終禁區(qū)，就以此作為迎擊使徒來(lái)襲的要塞都市。第三新東京市地表的大樓幾乎都是給eva機(jī)體提供支援和補(bǔ)給用的，各處都有eva專(zhuān)用裝備，總部發(fā)射eva至地面的發(fā)射口，電源插頭。在新劇場(chǎng)版里還有太陽(yáng)能發(fā)電的大樓，城市四周還有防御用的金屬板。城市周?chē)才鋫淞撕芏嗳祟?lèi)用的自動(dòng)武器對(duì)使徒進(jìn)行攻擊。還有eva維修的部門(mén)等，都需要聚集在一起。各種工作人員，還有為nerv服務(wù)的第三產(chǎn)業(yè)人員們也需要生活區(qū)域，在動(dòng)畫(huà)初期還有很多普通市民住在第三新東京市，但后來(lái)隨著戰(zhàn)斗烈度擴(kuò)大，很多市民都搬走了，所以最后就有了第三新東京市這個(gè)要塞都市，完全為了迎擊使徒而存在。