長期零申報會給企業帶來一定的風險，一是來自市場監督管理部門，二是來自稅務部門。這里的零申報并非申報的收入為零就屬于零申報，零申報是指申報的收入、成本費用以及利潤均為0，即相當于企業沒有進行經營活動。

站在市場監督管理部門的角度，希望企業是一個有經營活動的公司。根據《公司登記管理條例》第六十二條規定，公司成立之后無正當理由超過6個月未開業的，或這開業后自行停業連續6個月以上的，由公司登記機關吊銷營業執照。

一年一度的工商年檢正在進行（次年1月1日至6月30日辦理上年度工商年報），在工商年報填列的“資產狀況信息”具體項目中，就包括企業的“營業總收入”“主營業務收入”“利潤總額”以及“凈利潤”信息。若企業工商登記取得營業執照超過6個月，而工商年報中申報的“營業總收入”“利潤總額”以及“凈利潤”依然為0，則本企業可能尚未開業，或則自行停業，就存在被吊銷營業執照的風險。因為企業但凡開業，即使處于籌建期，沒有收入，也會存在成本費用開支，那么利潤就不可能為0。

站在稅務方面，稅務機關最關心的是企業應繳納的稅款是否均已足額繳納，企業是否經營不歸稅務機關管理。但是當企業長期零報稅時，稅務機關可能會懷疑企業存在賬外經營，一個公司成立之后，長期未申報收入，是否存在隱瞞收入的情況，即使沒有收入，企業經營活動也會產生成本費用支出，比如企業總歸要有經營場所，那么就會產生租金或折舊費用，企業需要向員工發放工資等。

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實務中，存在一些企業，增值稅、企業所得稅均零申報，但老板個人卡流水卻很大，或則從申報信息看著沒有進行經濟活動，但對公賬戶上卻有頻繁的流水。這些跡象均會引起稅務機關的關注，會認為企業納稅申報是亂填的，或存在主觀上的隱瞞收入偷逃稅款，一旦被稅務稽查，發現企業確實存在賬外經營（兩套賬），企業不僅面臨補繳稅款（涉及增值稅、附加稅費、企業所得稅、個人所得稅），還會受到加收每日萬分之五的滯納金，以及罰款，實際給企業帶來的損失相當嚴重。

對于企業而言，我們可以合理合規地利用各種稅收優惠政策來降低整體稅負，但企業既然存在經營活動，就要合規申報，不要想著長期零申報，一點稅不交。若企業確實沒有進行經營，那么建議及時去辦理注銷手續。