考慮到蛇如今的多樣性（近500個屬，約3,000個已命名物種），我們對蛇的最終起源仍然知之甚少。顯然，這些冷血、滑行、無腿的生物是從四足爬行動物祖先進化而來的，它們要么是小型、穴居、陸地蜥蜴（流行的理論），要么是一億年前出現在地球周圍海洋中的海洋爬行動物科滄龍進化而來。

一、拼湊蛇的進化

為什么蛇的進化是一個永恒的謎？問題的一個重要部分是，絕大多數蛇都是小型、相對脆弱的生物，它們甚至更小、更脆弱的祖先在化石記錄中以不完整的遺骸代表，大部分由分散的椎骨組成。古生物學家發現了假定的蛇化石，其歷史可以追溯到1.5億年前，即侏羅紀晚期，但這些痕跡是如此短暫，幾乎毫無用處。（讓事情變得更加復雜的是，被稱為“astopods”的蛇形兩棲動物出現在三億多年前的化石記錄中，最著名的屬是Ophiderpeton；它們與現代蛇完全無關。）不過，最近出現了確鑿的化石證據： Eophis，一種3米長的中侏羅紀蛇，原產于英國。

二、白堊紀早期的蛇

不用說，蛇進化的關鍵事件是這些爬行動物的前肢和后肢逐漸枯萎。神創論者喜歡聲稱化石記錄中不存在這樣的“過渡形式”，但就史前蛇而言，他們是完全錯誤的：古生物學家已經識別出不少于四個不同的屬，其歷史可以追溯到白堊紀時期，即配備有粗短、退化的后腿。奇怪的是，其中三種蛇——Eupodophis、Haasiophis 和 Pachyrhachis——是在中東發現的，而不是化石活動的溫床，而第四種蛇，Najash，生活在世界的另一端，南美洲。

這些兩條腿的祖先揭示了蛇進化的哪些秘密？嗯，這個答案很復雜，因為中東的屬是首先被發現的——而且，由于它們在一億年前淹沒在水中的地質地層中被發現，古生物學家將其作為蛇作為一個整體進化的證據來自水棲爬行動物，很可能是白堊紀晚期光滑、兇猛的滄龍。不幸的是，南美納賈什人對這一理論提出了質疑：這種兩條腿的蛇顯然是陸生蛇，并且與它的中東表親幾乎同時出現在化石記錄中。

如今，普遍的觀點是，蛇是從白堊紀早期的一種尚未鑒定的陸地蜥蜴（可能是穴居蜥蜴）進化而來的，很可能是一種被稱為“varanid”的蜥蜴。如今，巨蜥科動物以巨蜥（巨蜥屬）為代表，這是地球上現存最大的蜥蜴。奇怪的是，史前蛇可能是巨型史前巨蜥巨蜥的表親，巨蜥從頭到尾長約7.5米，重量超過兩噸！

三、新生代的史前巨型蛇

說到巨型巨蜥，一些史前蛇也達到了巨大的體型，盡管化石證據再次令人沮喪地缺乏結論。直到最近，化石記錄中最大的史前蛇被恰當地命名為Gigantophis，這是一種始新世晚期的怪物，從頭到尾長約10米，重達半噸。從技術上講，Gigantophis 被歸類為“madtsoiid”蛇，這意味著它與廣泛分布的 Madtsoia 屬密切相關。

不幸的是，對于巨型蛇的粉絲來說，這種史前蛇在記錄中的地位已經被一個更大的屬、一個更酷的名字所掩蓋：南美泰坦巨蟒，它長超過15米，重量可能達到一噸。奇怪的是，泰坦巨蟒的歷史可以追溯到古新世中期，大約在恐龍滅絕之后五百萬年，但在哺乳動物進化成巨型體型之前數百萬年。

唯一合乎邏輯的結論是，這條史前蛇捕食了同樣巨大的史前鱷魚，這種場景你可以在未來的電視特別節目中看到計算機模擬的場景；它也可能偶爾與同樣巨大的史前烏龜Carbonemys有過接觸。