工程施工企業進行會計核算應該是：借：主營業務成本；貸：工程施工；借：預收帳款；貸：主營業務收入；工程施工，機械作業，輔助生產，工程結算成本 ，工程結算收入；生產成本，工程施工，生產成本，機械作業，生產成本輔助生產，主營業務成本，主營業務收入等。