柚子苦主要是由于柚子內的生物苷而導致，在開花授粉的時候，有可能接觸到類似苦瓜這些味道比較苦的植物的花粉，結了果會帶有苦味。在生長過程中缺乏營養元素，也會導致有苦味，放置時間過久，就會增加柚子中的苦澀成分。