魚元子可以冷凍。若是將魚元子冷藏保存，只能保存1至2天，并且會因冷藏而無法保留原有的口感，因此冷凍是最佳的保存方法。將制作完成的魚元子放置在陰涼通風的環境下靜置三個小時，至其完全涼透后，裝入保鮮袋，再將其放入冰箱的冷凍室中，可保存10天左右。