一般情況下，企業取得的增值稅普通發票不能作為有效抵扣憑證抵扣增值稅（除了通行費電子普通發票、農產品銷售發票及農產品收購發票），對應采購行為支付價款中包含的稅額不得計入進項稅額，應直接計入相關資產的入賬價值或相關費用科目。

企業采購原材料、庫存商品等取得普通發票時：

借：原材料/庫存商品等（價稅合計數）

貸：應付賬款/銀行存款等

企業采購相關服務（比如法律咨詢、財務咨詢、職工培訓等）取得普通發票：

借：管理費用/銷售費用等（價稅合計）

貸：應付賬款/其他應付款/銀行存款等

企業取得通行費電子普通發票，按照發票上注明的稅額抵扣增值稅：

借：管理費用/銷售費用等——差旅費

應交稅費——應交增值稅（進項稅額）

貸：銀行存款等

一般納稅人企業采購免稅農產品取得（開具）農產品銷售發票或農產品收購發票的，以農產品銷售發票或收購發票上注明的農產品買價和9%的扣除率計算進項稅額，如果采購農產品用于生產對應稅率為13%的應稅貨物的，可加計1%，扣除率為10%計算進項稅額。

借：原材料（作為原材料生產其他應稅商品）/管理費用——職工福利費（公司食堂買菜）（買價-買價×扣除率）

應交稅費——應交增值稅（進項稅額）（買價×扣除率）

貸：銀行存款/應付賬款來源: www.ws46.com

實務中，如果企業屬于一般納稅人企業，則不管采購方企業屬于一般納稅人還是小規模納稅人，出于理性思維的考慮，均應要求對方提供專用發票（除了用于不得抵扣進項稅額的情形，比如購進貸款服務、餐飲服務、居民日常服務、娛樂服務、用于免稅項目、簡易計稅項目、集體服務及個人消費等），因為專票可以抵扣增值稅，在采購含稅價款相等的形況下，相當于取得專票的成本比取得普票的成本低。

如果一般納稅人企業存在大量普通發票入賬，可能會被認為涉嫌虛開普通發票（購入普通發票入賬，增加成本費用開支，少繳企業所得稅）。

如果納稅人屬于小規模納稅人，即使取得專票也不得抵扣增值稅，因小規模納稅人增值稅計稅方式為簡易計稅，應納稅額為不含稅銷售額與適用征收率之間的乘積，進項稅額不得抵扣。所以小規模納稅人日常經營活動，取得的為普票，入賬價值均以含稅價入賬，不涉及進項稅額。