中科院分區(qū)和jcr分區(qū)的學科劃分不同、參考的期刊影響因子年限不同、分區(qū)不同、分區(qū)閾值不同、期刊學科分類不同、分區(qū)方法不同、指標取值不同、寫法不同、IF取值不同、分類體系不同。

學科劃分不同

湯森路透JCR的Journal Ranking沒有設置大類學科，只分為176個具體學科，也就是中科院分區(qū)表中所指的小類學科。

參考的期刊影響因子年限不同

JCR分區(qū)參考的是上一年度的影響因子，而中科院分區(qū)參考的卻是前三年的平均影響因子。

分區(qū)不同

中科院期刊分區(qū)表常用1—4區(qū)，且分區(qū)前常用大類或者小類，1區(qū)只有5%的頂級期刊，2—4區(qū)期刊數(shù)量也逐層增加，常用說法為某本期刊在大類某學科為某區(qū)；JCR分區(qū)常用Q1—Q4（Q表示Quartile in Category），即4個等級中所處的位置，常用說法為某本期刊位于某學科的Q幾，如描述期刊Nature的2014的JCR等級情況：期刊Nature位于Multidisciplinary Sciences學科的Q1。

分區(qū)閾值不同

JCR分區(qū)是按每區(qū)25%的等比例進行劃分，中科院分區(qū)的一區(qū)、二區(qū)和三區(qū)的閾值均高于JCR分區(qū)的一二三區(qū)。

期刊學科分類不同

JCR分區(qū)是按照小類劃分，共有176個。而中科院分區(qū)是將176個小類劃分為14個學科門類。

分區(qū)方法不同

JCR是按照“平均主義”思想，根據(jù)刊物IF的高至低平均劃分4個區(qū)，每個區(qū)含有該領域總量25%的期刊；

中科院的分區(qū)如同社會階層的金字塔結構，1區(qū)只有5%的頂級期刊，2~4區(qū)期刊數(shù)量也逐層增加。于是，采用中科院分區(qū)后往往出現(xiàn)“掉區(qū)”的情況。

顯然中科院的1區(qū)和2區(qū)雜志很少，雜志質量相對也高，基本都是本領域的頂級期刊。所以有的人發(fā)表的論文按JCR分區(qū)標準算一區(qū)，而按中科院分區(qū)算2區(qū)甚至三區(qū)。

指標取值不同

JCR是按當期（1年）的IF進行分區(qū)，中科院是按刊物前3年IF平均值進行分區(qū)。

寫法不同

中科院分區(qū)和jcr分區(qū)，雖然都是四個分區(qū)，但兩個分區(qū)的寫法是不同的。中科院分區(qū)分別是1區(qū)、2區(qū)、3區(qū)、4區(qū)。jcr分區(qū)分別是Q1、Q2、Q3、Q4。

IF取值不同

中科院分區(qū)和jcr分區(qū)采用的都是同一學科期刊，按IF降序排列，劃分為不同的分區(qū)。但中科院是按刊物前3年IF平均值進行分區(qū)，jcr是按當期(1年)的IF進行分區(qū)。

分類體系不同

中科院分區(qū)有大類和小類之分，而jcr分區(qū)只有小類。在小類上，兩者是一樣的。

作者發(fā)表SCI論文時，經(jīng)常會遇到分區(qū)的限定條件，比如中科院1區(qū)，jcrQ1等。雖然兩個分區(qū)都有可能出現(xiàn)，但大多數(shù)時候，國內作者還是以中科院分區(qū)為準。