增值稅一般納稅人從農業生產者購進免稅農產品可以憑取得的農產品銷售發票或開具的收購發票上注明的買價乘以扣除率計算進項稅額抵扣增值稅。

增值稅一般納稅人購進農產品可以根據供應商身份以及取得發票的類型可以分為以下4種情況：

1、取得一般納稅人開具的增值稅專用發票

供應商為一般納稅人，且對方開具了增值稅專用發票，按照發票上注明的稅額抵扣增值稅，取得增值稅專用發票，勾選認證抵扣即可，無需額外計算準予抵扣的進項稅額。(www.ws46.Com)

2、取得小規模納稅人開具的增值稅專用發票

從小規模納稅人處采購農產品，取得小規模納稅人開具的3%的增值稅專用發票，不要勾選認證抵扣，準予抵扣的進項稅額需要計算。

進項稅額=發票上注明的金額×扣除率

納稅人購進農產品生產初級農副產品或直接對外銷售的，扣除率為9%；納稅人購進農產品用于深加工生產或委托加工13%稅率的貨物，扣除率加計1%，即扣除率為10%。

一般納稅人從小規模納稅人處采購農產品，取得免稅普通發票的，進項稅額不得抵扣，比如從從事蔬菜批發、零售的納稅人處購進蔬菜取得對方開具的免稅普通發票，不得計算抵扣進項稅額。

3、向農業生產者或農民專業合作社購進自產農產品

一般納稅人向農業生產者或農民專業合作社購進其自產的農產品，可以憑借對方到稅局代開的免稅農產品銷售發票或納稅人自行開具的農產品收購發票計算抵扣進項稅額。

進項稅額=買價×扣除率

買價是指納稅人購進農產品在農產品收購發票或者銷售發票上注明的價款和按照規定繳納的煙葉稅。

扣除率依然根據納稅人購進農產品后生產銷售的產品適用稅率確定，生產適用9%稅率的初級農副產品，則扣除率為9%，生產適用13%稅率的應稅商品的，扣除率為10%。

4、納稅人購進進口農產品

一般納稅人直接購進農產品，憑取得的海關進口增值稅專用繳款書上注明的稅額抵扣增值，無需計算進項稅額。

一般納稅人企業職工食堂購進農產品用于職工福利，進項稅額不得抵扣。根據《財政部、國家稅務總局 關于全面推開營業稅改征增值稅試點的通知》（財稅2016年36號）第二十七條規定，用于簡易計稅方法計稅項目、免征增值稅項目、集體福利或者個人消費的購進貨物、加工修理修配勞務、服務、無形資產和不動產，進項稅額不得從銷項稅額中扣除。