納稅人取得（或開具）農產品銷售發票（或收購發票）的，以農產品銷售發票（或收購發票）上注明的農產品買價和9%的扣除率計算進項稅額。

可抵扣進項稅額=買價×扣除率=買價×9%

這里計算進項稅額時，形式上看起來買價并未剔除增值稅，實際上買價即為不含稅售價，因為農業生產者銷售其自產農產品，免征增值稅。農業生產者銷售自自產農產品，享受免稅政策，則稅率為零，對外售價含稅價和不含稅價一致。需要注意這里的農產品是指種植業、養殖業、林業、牧業、水產業生產的各類植物、動物的初級產品。

納稅人從按照簡易計稅方法依照3%征收率計算繳納增值稅的小規模納稅人處采購農產品取得增值稅專用發票的，以增值稅專用發票上注明的金額和9%的扣除率計算進項稅額。

可抵扣進項稅額=專用發票上注明金額×9%

需要注意，從小規模納稅人處取得3%征收率的增值稅專用發票，才可以計算抵扣增值稅，若取得的為適用3%征收率的普通發票，則不得抵扣進項稅額。此時，需要注意，入賬的采購成本并不是發票上注明的不含稅金額，而是含稅金額扣除可以抵扣進項稅額后的差額，比如采購不含稅價格為100萬，增值稅專用發票上的稅額為3萬，進項稅額不再憑發票抵扣，而需要計算抵扣，可抵扣進項稅額為100×9%=9萬，原材料或庫存商品的入賬成本為103-9=94萬。

以上兩種情況，納稅人從農業生產者處采購農產品，取得農業生產者開具的農產品銷售發票，或自行開具的農產品收購發票以及從小規模納稅人處購進農產品，取得對方開具3%征收率的增值稅專用發票，進項稅額需要計算，扣除率為9%。(www.ws46.cOm)

2019年4月1日起，納稅人購進農產品，扣除率為9%，在領用農產品環節，如果農產品用于生產或委托加工13%稅率貨物，則再加計1%抵扣進項稅額。

即對于納稅人購進農產品，用于生產適用13%稅率的貨物，合計扣除率為10%。

1%加計扣除率并不是只有計算抵扣進項稅額的情況，才可以享受，納稅人購進農產品，取得一般納稅人開具的增值稅專用發票或海關進口增值稅專用繳款書的，以注明的增值稅稅額為進項稅額，這種無需計算進項稅額的情況，購進用于生產13%稅率的貨物依然可以享受1%的加計扣除，比如納稅人進口大豆用于生產豆乳食品，進口增值稅專用繳款書中注明的稅率為9%的稅額，可以抵扣增值稅，用于生產適用13稅率的食品，領用環節可以享受價加計1%的優惠。

舉例：納稅人甲公司（一般納稅人）從農戶手中采購小麥，用于生產餅干，農產品收購發票上注明買價為10萬元，甲公司準予抵扣的進項稅額為多少，會計如何核算？

購進環節，開具農產品收購發票當期，準予抵扣進項稅額為：10×9%=0.9萬；倒擠出成本9.1萬計入原材料入賬成本；甲公司購進小麥用于生產餅干，餅干適用13%稅率，領用小麥原材料當期，可以加計1%扣除，加計1%扣除，確認10×1%=0.1萬的進項稅額，同時沖減原材料入賬成本。

具體會計分錄如下：

購進環節：

借：原材料 9.1

應交稅費——應交增值稅（進項稅額）0.9

貸：銀行存款 10

領用環節：

借：應交稅費——應交增值稅（進項稅額）0.1

貸：原材料 0.1