蛋白質的一級結構就是蛋白質多肽鏈中氨基酸殘基的排列順序，也是蛋白質最基本的結構。

蛋白質的一級結構是由基因上遺傳密碼的排列順序所決定的。各種氨基酸按遺傳密碼的順序，通過肽鍵連接起來，成為多肽鏈，所以肽鍵是蛋白質結構中的主鍵。

蛋白質結構

蛋白質分子是由氨基酸首尾相連縮合而成的共價多肽鏈，但是天然蛋白質分子并不是走向隨機的松散多肽鏈。每一種天然蛋白質都有自己特有的空間結構或稱；三維結構，這種三維結構通常被稱為蛋白質的構象，即蛋白質的結構。

級別分類

蛋白質的空間結構結構可劃分為四級，以描述其不同的方面：

一級結構：組成蛋白質多肽鏈的線性氨基酸序列。

二級結構：依靠不同氨基酸之間的C=O和N-H基團間的氫鍵形成的穩(wěn)定結構，主要為a螺旋和折疊。

三級結構：通過多個二級結構元素在三維空間的排列所形成的一個蛋白質分子的三維結構。

四級結構：用于描述有不同多肽鏈(亞基)間相互作用形成具有功能的蛋白質復合物分子。