1、存儲環境:蜂蜜要放在陰涼、干燥、通風的環境下保存，有條件時最好能放在冰箱的冷藏室中保存，同時蜂蜜在保存過程中一定要謹防發生串味，例如長期與大蒜保存在一起可能會使蜂蜜有一股大蒜味，另外蜂蜜絕對不能和有毒或有害的物質一起保存。

2、保存容器:蜂蜜的保存容器主要有玻璃瓶、陶瓷瓶、塑料瓶三種，其中長期保存時最好選擇玻璃瓶或陶瓷瓶，而短期保存則可選用無毒且衛生的塑料瓶，值得注意的是蜂蜜不能用金屬容器保存，原因是蜂蜜中的有機酸等酸性物質會和金屬發生化學反應。

3、完全密:蜜蜂一定要嚴格密封保存，原因是蜂蜜有天然的潤澤性且能吸收空氣中的水分，水分進入蜂蜜中會破壞蜂蜜的抗菌能力，當水分含量達到一定值時蜂蜜就可能因微生物大量繁殖而變質，另外密封保存還能有效防止空氣中的微生物進入蜂蜜中。

4、正確取用：蜜蜂保存過程中不建議頻繁的取用，若必須取用也要用干燥且衛生的勺子，事實上蜂蜜提前變質往往都是不正確取用引起的，例如頻繁用帶水的勺子取用會破壞蜂蜜內部的滲透壓和抗菌能力，最終整瓶蜂蜜都將因微生物大量繁殖而提前變質。