1、濃縮膠的作用：濃縮膠有堆積作用。帶電荷的蛋白質或核酸離子在大孔徑膠中移動時阻力小，移動速度快，當接近小孔徑的分離膠時，遇到的阻力大，移動速度減慢而使樣品濃縮，形成一條狹窄區帶，以減少電泳過程中的譜帶擴散。2、分離膠的作用：蛋白質或核酸在電泳過程中由濃縮膠進入分離膠，由于分子篩作用，小分子的物質容易通過，阻力小，遷移速度快；大分子的則受到較大的阻力而被滯后。