1、從概念上講,部門”和單位”各自的定義不同：單位和部門從概念本身而言，單位指某個獨立的組織或機構，部門指獨立組織的某功能部分；2、從性質上講，部門”和單位”性質不同：單位是相對與個人而言的，單位一般是度法人,是一個比較完整的、相對獨立的社會組織。而通常所說的部門是若干個性質相同或相似的某一類單位，當然部門也可以指一個單位內部的工作機構，也指政府的工作部門內，如交通部、人事部等。3、從范圍上講，部門”和單位”各自的范圍不同：單位范圍很廣，不僅包括職能部門，也包括各級人民政府本身，還包括各級人民政府或職能部門的派出機構。嚴格地說，在國家機關中，部門是指各級人民政府的職能機構，如公安局有時稱公安部門、工商局有時稱工商部門等等。是履行法律賦予的一方面職權的機構，是政府的一個組成部分。不過，部門”容和單位”沒有絕對的大小比較，都是相對而言的。有的部門下設的單位比較多，有的部門下設的單位比較少；反之有的單位是由很多部門構成，有的單位則是由較少的部門構成。