曉組織總共有13為組員，各自是批杷長十郎、阿飛、飛段、宇智波鼬、大蛇丸、迪達拉、視角、干柿鬼鮫、蝎、絕、小南和佩恩。

曉組織最開始創立的目地是以便搭建維護世界和平，已不有戰事，長門和彌彥及其小南構成了曉組織，接著機構的陣營愈來愈大，機構在雨忍村及其忍界的知名度也更高某些，這件事情被雨忍村的頭領山椒魚半藏知道，假如再拖下來，本身的影響力也不保，和我團藏商議后，決策殺死曉組織，接著和彌彥約好交涉，布下圈套，半藏將小南當人質，用彌彥的生命來換，接著彌彥倒在了長門的苦無上，長門很惱怒，通靈出了外道魔像將半藏的手底下限時秒殺，半藏用瞬身術逃走。

接著長門運用輪回眼的能力建立了佩恩六道，殺掉了山椒魚半藏，接著長門認可了帶土的月之眼計劃，曉組織逐步形成了叛忍機構。