可以采用生物降解技術處理磷物質、處理氮、去除臭味等辦法去除水中的綠藻。1、藻類主要由水中的過剩營養物質所引起。大多數湖泊和水庫由于水體更新緩慢，營養物質（氮、磷和有機物）過載，這些過剩營養物質超過了水體的自凈能力，同時為藻類生長創造環境。生物降解技術的微生物在細胞團塊中消耗這些過剩營養物質，在競爭中勝過藻類，截斷了藻類的有效養分來源。３、過多的磷，已經被認為是藻類和水生雜草迅速生長的最主要因素。微生物或者細菌是具有兩個基本功能的很簡單的有機體：新陳代謝，吃和繁殖。細菌為實現必要的生命功能需要磷。生物降解技術的細菌在它們的細胞團塊中消耗磷，使之不能作為藻類或水生雜草的營養物。生物降解技術產品中的酶擔當生物催化劑作用。４、在水中，氮是幾種形態存在的：氨，亞硝酸鹽和硝酸鹽。生物降解技術方案將打破復雜的氮的存在形式，變成分子氮，以氣體存在。這些氮氣將經由水中除去，溢出到水面，離開水生環境。５、大多數湖泊和水塘的臭味由藻類死亡以及水體缺氧產生的硫化氫（臭雞蛋味）、硫、氨等物質所引起。生物降解技術含有精選的細菌，這些細菌可以迅速降解死亡的藻類并且與外界產生硫化氫的細菌競爭，從而清除硫化氫、氨等引起的臭味。由于硫在底泥中大量存在，生物降解技術的細菌和酶配方打破底泥中硫的生物鏈，使之不能存活。生物降解技術促進氮循環，提高氨轉變為亞硝酸鹽的比率，減少氨的含量。