紅色，紅色瑪瑙較為常見，紅色瑪瑙中的南紅瑪瑙價值較高；藍色，藍瑪瑙受因為內部含有銅形成的，銅含量的多少決定藍瑪瑙顏色的深淺；黑色，黑瑪瑙因為內部含有膠體礦物而形成，象征著堅毅的力量；白色，白瑪瑙經常用于珠子的制作，分為透明和不透明兩者；綠色，綠色瑪瑙稱為綠玉髓，在自然界中較為罕見。

1、紅色

瑪瑙的顏色有紅色，紅色的瑪瑙最為多見，在古代稱為赤玉與珍珠并列為珠寶一類。紅瑪瑙中有東紅瑪瑙和西紅瑪瑙，東紅瑪瑙是選用優質的白瑪瑙經過加熱冷卻后，染成的紅色瑪瑙。西紅瑪瑙是我國新疆的天然紅瑪瑙，因為出土西域被稱為西紅瑪瑙，自身結構紋帶非常迷人。

2、藍色

瑪瑙的顏色有藍色，藍色瑪瑙因為含銅量的原因而呈現藍色，含銅量的多少直接影響藍玉髓的外表顏色。新的藍瑪瑙可以放在海鹽當中進行清洗凈化晶石的磁場。或放于霜雪中，深埋數小時也可達到凈化的效果。藍色瑪瑙顏色高貴，長期佩戴能夠增加自我魅力。

3、黑色

瑪瑙的顏色有黑色，黑色瑪瑙是膠體礦物，在礦物學中屬于玉髓類。黑瑪瑙象征著堅毅，是一種廣泛玉料。黑瑪瑙主要是含有較多的有機物質引起的，純黑的整塊的黑瑪瑙在自然界中比較少見，大部分是有機含量不夠導致呈現出深淺不同的條帶。來源: www.ws46.com

4、白色

瑪瑙的顏色有白色，白瑪瑙是以白色為主色調。多用于制作珠子，自身猶如水晶，整體透明無顏色。白色瑪瑙分為兩種一種是透明狀一種是不透明狀，透明的白瑪瑙顏色皓白如凡，能夠清晰的看到內部的層次變化。不透明者細看能發現少量變化的硅膠層次。

5、綠色

瑪瑙的顏色有綠色，綠色瑪瑙稱為綠玉髓，是一種準晶體結構的礦石，構成水晶相當質量很好，在普通的放大鏡下無法觀察到內部的雜質。綠玉髓是一種呈現不同色調的綠色，有微透明至半透明。綠玉髓產量稀少，色彩誘人，是最具價值的石英礦石之一，與翡翠相似。