消化池結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)中需要重點(diǎn)考慮的是設(shè)備壽命和熱損失。城市污水處理廠的設(shè)備，通常的設(shè)計(jì)壽命為40～50年，而工業(yè)廢水處理廠的設(shè)備，設(shè)計(jì)壽命可能只有15年。

消化池內(nèi)物料的溫度與外部環(huán)境溫度差會(huì)影響消化池的結(jié)構(gòu)。因此對(duì)設(shè)計(jì)者來(lái)說(shuō)消化池的操作溫度和當(dāng)?shù)貧夂蚴墙Y(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)中的重要因素。大多數(shù)厭氧消化池在中溫范圍操作，但在設(shè)計(jì)消化池結(jié)構(gòu)時(shí)可能希望其能在高溫區(qū)操作。

設(shè)計(jì)者首選的消化池池形是圓形，因?yàn)榉叫位蚓匦纬鼗旌喜痪鶆颍≡蜕笆姆e累多，轉(zhuǎn)角處壓力大，因此，至少靠近矩形池轉(zhuǎn)角附近要求更厚的墻體。而卵形池墻體彎曲，結(jié)構(gòu)復(fù)雜，其造價(jià)通常要比圓形池高得多。

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若采用混凝土固定消化池蓋，一般將其設(shè)計(jì)成平板形，因?yàn)檫@樣建造起來(lái)最容易。鋼制固定蓋常設(shè)計(jì)成圓錐形，并帶有框架支柱。混凝土和鋼制固定蓋均在工程實(shí)際中得到了廣泛應(yīng)用。

在易于發(fā)生地震的地方，消化池結(jié)構(gòu)需要做特殊的考慮。在地震期間及地震后，結(jié)構(gòu)的損壞導(dǎo)致消化池內(nèi)液體的外泄，浮動(dòng)蓋的鑄件和軸承特別容易損壞。管路連接應(yīng)當(dāng)靈活，允許不同方向的運(yùn)動(dòng)。