上杭的主要河流有汀江、舊縣河、黃潭河。1、汀江是福建省的四大河流之一，發源于寧化縣境內牧馬山北坡，經長汀縣于回龍入境，由北向南縱貫全縣。2、舊縣河為上杭第二大河，發源于連城縣朋口畢華山南麓，經連城車頭入縣境內的南陽、舊縣，在臨城鎮九州與汀江干流匯合。3、黃潭河為上杭第三大河，發源于古田高寨山南麓和蛟洋大人崠，分別流至古田的蘇家坡匯合，經吊鐘巖入龍巖境，在橋下灘又折回上杭溪口、太拔、藍溪、稔田，至永定池溪鄉下河口與汀江干流匯合。