含油量高，南瓜籽油碘值高達118g/100g。南瓜籽主要功能是作為南瓜的傳播方式，因此在自然進化的過程當中，種子里會保留比較多的油脂成分，有助于給南瓜籽的發芽提供更多的營養物質，南瓜籽主要的油脂是不飽和的脂肪酸，脂肪酸主要由棕櫚酸、硬脂酸、油酸、亞油酸及少量的月桂酸、棕櫚油酸、亞麻酸、花生酸等八種酸組成。